1. 通過基因工程手段替換引起多肽不穩定的殘基或引入能增加多肽穩定性的殘基，可提高多肽的穩定性。

2. 多肽的化學修飾方法很多，研究最多的是PEG修飾。PEG是一種水溶性高分子化合物，在體內可降解，無毒。PEG與多肽結合后能提高熱穩定性，抵抗蛋白酶的降解，降低抗原性，延長體內半衰期。選擇合適的修飾方法和控制修飾程度可體質或提高原生物活性。

3. 通過加入添加劑，如糖類、多元醇、明膠、氨基酸和某些鹽類，可以提高多肽的穩定性。糖和多元醇在低濃度下迫使更多的水分子圍繞在蛋白質周圍，因而提高了多肽的穩定性。在凍干過程中，上述物質還可以取代水而與多肽形成氫鍵來穩定多肽的天然構象，而且還可以提高凍干制品的玻璃化溫度?！〈送獗砻婊钚詣┤?span>SDS、Tween、Pluronic,能防止多肽表面吸附、聚集和沉淀。

4. 多肽發生的一系列化學反應如脫酰胺、β-消除、水解等都需要水參與，水還可以作為其它反應劑的流動相。另外，水含量降低可使多肽的變性溫度升高。因此，凍干可提高多肽的穩定性。

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